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ATAC-Seq

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ATAC-Seq基于将测序引物的媒介转座酶插入到开放的染色质区域。这一分析提供了染色质开放和可进入性区域的基因组分布。

 
为什么研究开放染色质呢?

可洞察基因调控,细胞对治疗或疾病的反应

确定哪些转录因子正在影响细胞的命运、疾病或反应

原代组织或细胞,如胰岛β细胞

有限的患者样本

根据开放的染色质标签对患者或样本组进行分层

 
 

The ATAC-Seq实验包括:

1、细胞准备;
2、转座酶反应;
3、文库扩增;
4、基于Illumina平台的测序;
5、生物信息学分析。

样本类型:

1、人类和动物组织(包括异种移植物和人类活组织检查);
2、原代细胞(包括T细胞和B细胞);
3、流式细胞仪分选的细胞;
4、最罕见的细胞群。

 

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